针对巴尔喀什湖百余年来的湖水位变化与伊犁河三角洲生态环境退化问题,选取卡依尔干、卡上171km、卡普恰盖、乌斯热尔玛等4处水文站的长系列资料,对伊犁河干流径流沿程变化情况进行分析,比较了卡普恰盖水库建成蓄水前后其对水库下游河道径流变化的影响。研究结果认为,巴尔喀什湖的水位变化主要受流域水文情势周期性变化规律的影响。就近期的水位变化情况来看,并未出现生态灾难,水位呈回升趋势。卡普恰盖水库的兴建和伊犁河中下游水资源过度开发利用,对入湖水量和河道流量过程产生了重大影响,这是导致入湖水量减少和三角洲生态环境恶化的根本原因。最后针对湖水位长期变化动态特征和三角洲生态耗水要求,考虑非生态用水不断增长的现实情况,探讨了解决巴尔喀什湖生态环境问题的对策措施。