新疆地区盐湖的中度嗜盐菌16S rDNA全序列及DNA同源性分析

被引：43

作者：

曾静

窦岳坦

王磊

杨苏声

机构：

[1] 中国农业大学生物学院微生物学系

来源：

微生物学报 | 2002年 / 02期

关键词：

新疆地区; 16S rDNA全序列; DNA-DNA杂交; 系统发育;

D O I：

10.13343/j.cnki.wsxb.2002.02.001

中图分类号：

Q93-331 [微生物鉴定];

学科分类号：

摘要：

通过数值分类和 1 6SrDNAPCR RFLP分析 ,对分离自新疆地区的中度嗜盐革兰氏阴性菌进行研究 ,发现了一个新类群。在此基础上 ,进行了中心株AI 3的 1 6SrDNA全序列分析 ,并与中度嗜盐菌已知种和相关种进行比较 ,得到系统发育树状图。在此树状图中 ,大多数参比菌株聚在一起 ,其 1 6SrDNA全序列的同源性在 96 %以上 ,而AI 3与参比菌株的 1 6SrDNA全序列相比 ,其相似性低于 75 %。但是 ,AI 3与Alcanivoraxborkumensis[1] 的 1 6SrDNA全序列的相似性为 96 % ,与Halobacilluslitoralis的 1 6SrDNA全序列的相似性为 99% ,三者构成一个独立的发育分支。这说明在系统发育上 ,AI 3与参比菌株属于不同的分支 ,是一个新的类群。在新类群内 ,菌株之间的DNA同源性大于 70 % ,而中心株AI 3与标准菌株伸长盐单胞菌(Halomonaselongata)的DNA同源性为 44% ,表明新分离的菌株可能构成一个新种群

引用

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